Denominado anteriormente Museo de Arqueología, funciona en una casona colonial construida por el almirante español Francisco Alderete Maldonado a principios del siglo XVII. De ahí que sea popularmente conocida como la Casa del Almirante. Se ubica a una cuadra de la Plaza de Armas y pertenece a la Universidad Nacional San Antonio Abad del Cusco. El nombre de Museo Inka indica una especialización temática, que intenta mostrar de manera ordenada la historia del Cusco desde la perspectiva inca, desde los tiempos prehispánicos hasta el siglo XX. Exposición: Colección de piezas arqueológicas de la cultura Inca. Muestra de objetos prehispánicos: líticos, metalurgia funeraria, cerámica, textilería, queros. Arquitectura Inca, metalurgia, textilería, trepanación de cráneos humanos, embalsamamiento de cuerpos, ídolos de oro, plata, cobre, turquesa, etc.; maquetas de centros arqueológicos, objetos de ritos ceremoniales. La colección cuenta con centenares de queros (en quechua qiru, "vaso"), puyños (en quechua puyñu, "cántaro o aríbalo") de todo tamaño. También una importante muestra de pintura colonial de la Escuela Cusqueña, en la que predominan los retratos de incas y curacas del siglo XVII.

Bueno, por mantenimiento de la Universidad Nacional San Antonio Abad del Cusco.

Se ubica en la Cuesta del Almirante 103. (Esquina con la calle Ataúd), a pocas cuadras de la Plaza de Armas.